La diversidad de los microorganismos de la tierra sigue siendo poco entendimiento destacado.
Enviado por Rebecca • 8 de Marzo de 2018 • 920 Palabras (4 Páginas) • 308 Visitas
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subunidad ribosomal genes de ARN (16S rARN) es útil para análisis de micro bial comunidades en varios hábitats [14] . El uso de alto rendimiento secuenciación corta lectura del amplicón 16S rRNA para la elaboración de perfiles de
omunidades microbianas se ha convertido en una opción cada vez más atractiva por investigadores como el amplicón se compone de la región conservada inter- spersed por regiones variables que facilitan la secuenciación y filogenético clasificación. La pirosecuenciación 454 GS-20 por Roche en 2006 fue de la primera tecnología de secuenciación de alto rendimiento aplicado con éxito para el análisis de la biodiversidad, y la mejora de la tecnología ofrece longitudes de lectura de hasta 1000 pb [15] . La tecnología de Illumina es muy eficaz en la realización de la profundidad secuenciación comparativamente alta de- A pesar de haber leído corta duración y reduce los costos básicos por [9,13,16] . Por lo tanto, esta tecnología se ha utilizado para la secuenciación de amplicón Los genes marcadores de bacterias y hongos para caracterizar comunicación microbiana lazos en la rizosfera y filósfera [17] . En este estudio, Illumina tecnología se aplicó para la secuenciación del ARNr 16S de orientación de la Regiones V3-V4 (amplicones de 150-400 pb) usando cebadores diseñados contra las regiones conservadas que rodean [18] . la bioinformática herramientas proporcionadas por mothur tubería se exploraron para procesar datos en bruto lee y analizar las comunidades microbiota. El trabajo previo hecho
utilizando la plataforma Illumina ha sugerido la efectividad de este fragmento tamaño que sea suficiente para resolver las diferencias comunidad microbiana [19] . Este estudio se centró en las comunidades endófitos del Aloe vera planta. En nuestro estudio independiente (trabajo no publicado), hemos caracterizado algunos de los endofitos cultivables aislamientos de A. vera con beneficioso compuestos bioactivos. plantas de Aloe son conocidos por su nutricional y valores terapéuticos. Los exudados de hoja se utilizan en gran medida en tradición medicina del trabajo [20] . Otros usos incluyen el tratamiento de heridas y quemaduras, También la diabetes y los lípidos elevados en la sangre en los seres humanos. Estos efectos son Se cree que es atribuida a compuestos tales como polisacáridos, mananos, flavonoides, antraquinonas, lectinas y otros fitoquímicos compuestos que se aíslan de la planta. Desenmascarando la en- general comunidades de bacterias dophytic pueden ayudar en la identificación y descripción la colonización microbiana planta tanto por el cultivables y unculturable especies y su relación con los compuestos bioactivos producidos. Por lo tanto, empleado la tecnología NGS para dar a conocer la cultivables y unculturable bacterias endofíticas en A. vera, y para dilucidar la planta microbiana patrón de colonización y evaluar su diversidad microbiana
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