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- Tratamiento Secundario o Tratamiento Biológico: el tratamiento biológico de las aguas residuales promueve el desarrollo de los microorganismos presentes en las aguas naturales que se agrupan en películas o flóculos que retienen la contaminación orgánica y se alimentan de ella. Existen múltiples tratamientos el más usado y usado por esta EDAR es el de fangos activados, proceso biológico que consiste en el desarrollo de un cultivo bacteriano disperso en forma de flóculo en un depósito agitado, aireado y alimentado con el agua residual, que es capaz de metabolizar como nutrientes los contaminantes biológicos presentes en esa agua.

Un proceso biológico de fangos activos se desarrolla en dos cámaras separadas:

Un reactor biológico, tanque agitado, aireado y alimentado con el agua residual, en el que se produce la parte biológica del proceso y un decantador secundario, tanque en el que sedimenta el fango producido, que es recirculado a la cabecera del tratamiento, y purgada para su eliminación la cantidad producida en exceso.

- Tratamiento Terciario: utiliza técnicas destinadas a pulir o afinar el vertido final, mejorando alguna de sus características. Si se emplea intensivamente pueden lograr hacer el agua de nuevo apta para el abastecimiento de necesidades agrícolas, industriales, e incluso para potabilización (reciclaje de efluentes).

Línea de Fangos: En el proceso de depuración se generan dos efluentes: el agua tratada que se vierte directamente a cauce, y los lodos. Éstos son el conjunto de los sólidos sedimentados en la decantación primaria (fangos primarios), y el licor mezcla en exceso del reactor biológico (fangos secundarios).

Dado su elevado contenido en agua (superior a un 95%), se hace necesario su tratamiento de cara a reducir su volumen y facilitar su manejo y transporte posterior. El destino final de los lodos es la reutilización agrícola.

Por ello en toda EDAR paralela a la línea de agua ha de existir una línea de fangos.

Los fangos procedentes de las decantaciones reciben un tratamiento especial (espesamiento, digestión, deshidratación) hasta que son susceptibles de ser tratados como residuo sólido urbano o incinerados, o bien a un subproducto capaz de, tras otros tratamientos como la estabilización o el compostaje, ser reutilizado como abono en la agricultura u otros usos.