Especies de vertebrados que existen actualmente en las áreas protegidas del país.

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- “Delfín” Especie amenazada de extinción a nivel nacional.

Bosque de Chaguantique:

- “Monos Araña” Especie en vías de extinción en nuestro país.

Parque Natural el Cerro Verde:

Muchos animales encuentran refugio en esta reserva, registrándose cerca de 127 especies de aves, de las cuales 17 son colibríes, entre ellos el “Mosardón”, cuyo peso es de tan solo 3 grs. cuando adulto. Otra especie de ave que es bastante común en el parque es el “Guardabarranco” (Myadestes unicolor veraepacis) que por su trino fuerte y melodioso se le ha considerado como una de las cinco mejores aves cantoras del mundo. También existen anfibios, algunos reptiles y una gran variedad de insectos, que están siendo identificados, con lo cual se tendrá mejor conocimiento de los animales que habitan en esta región.

Cerro el Pital:

- Pichones de Zorzal de Frantzii

- Colibrí Alicastaño (Lamprolaima rhami), especialista de zonas altas, vive en bosques nubosos, es una especie que en El Salvador, sólo ocurre en Cerro El Pital y en Montecristo.

-En El Pital existen muchas especies restringidas a las zonas altas, como:

- “Tecolote-abetero Sureño” (Aegolius ridgwayi)

- ”Chara de Niebla” (Cyanolyca pumilo)

- ”Momoto Gorjiazul” (Aspatha gularis)

- “Quetza” (Pharomachrus mocinno)

- “Pava Negra” (Penelopina nigra)

-Así como especies de anfibios y reptiles con limitada distribución como:

- Incilius ibarrai

- Plectrohyla sagorum

- P. psiloderma

- Geophis rhodogaster.

-Se conoce la presencia de más de 10 especies endémicas entre ellas Bolitoglossa synoria (McCraine & Köhler 1999).

Parque Nacional Montecristo - El Trifinio:

Posee una riqueza de 3000 especies de plantas, 280 especies de aves, 98 especies de mamíferos y 50 especies de anfibios y reptiles.

En los bosques de la Reserva de la Biósfera Trifinio Fraternidad, se han realizado nuevos reportes de especies de fauna para la ciencia entre ellos:

- Bolitoglossa heiroreias

- Ptychohyla salvadorensis

- Abronia montecristoi

- Norops heteropholidotus

- Geophis fulvoguttatus

- Rhadinaea Montecristi

- Rhadinaea kinkelini.

Existen además una gran cantidad de especies amenazadas y en peligro de extinción como:

- Tillandsia xerographica

- Heloderma horridum charlesbogerti

- Oreopanax lacnocephalu

- Bursera graveolens

- Persea steyermarkii

- P. oleifolius

- Cosmibuena matudae

- Exostema caribaeum

- Ulmus mexicana

- Cedrela odorata

- C. salvadorensis

- Caiman crocodilus

- Crocodylus acutus

- Dendroica chrysopharia

- Puma concolor

- Agouti paca

- Cannis latranns

- Puma yagouaroundi

- Leopardus pardalis

- L. wiedii

- Tayassu tajacu

El Imposible:

Conserva la mayor diversidad de flora y fauna de El Salvador. Alberga nuevas especies de árboles para la ciencia y fauna, específicamente de aves y mariposas. Es el último refugio de animales que se encuentran en peligro de extinción en el país.

Cuenta con 13 especies de peces, 4 especies de sapos y 7 ranas, 19 especies de lagartijas, 24 serpientes y 1 tortuga.

-Peces:

- “Tepemechín” (Agonostomus monticula) pez que vive y se observa en los depósitos del Río Guayapa, y que su presencia indica que hay oxigenación en el agua de los ríos.

-Anfibios:

- “Rana arborícola de ojos negros” (Agalychnis moreletii) Única especie salvadoreña considerada en peligro de extinción a nivel mundial y que habita en El Imposible.

- “Culebrina de Taylor” (Oedipina taylori) Salamandra reportada entre los anfibios del Parque.

-Reptiles:

- “Culebra timbo” (Atropoides nummifer)

- “Culebra Cascabel” (Crotalus simus)

- “Culebra Coral” (Micrurus nigrocinctus)

- “Culebra Falsa coral roja” (Lampropeltis triangulum)

- “Iguana verde” (Iguana iguana)

- “Tortuga candado” (Kinosternon scorpioides)

-Aves:

Estudiadas por el Proyecto Monitoreo de Aves del Programa de Ciencias de SalvaNATURA. El Parque cuenta con rutas de observación de aves para aficionados o expertos en este tema. Cuenta con 286 especies registradas, entre 65 migratorias y 61 visitantes irregulares, y algunas son restringidas a El Imposible:

- “Pavo cobolito” (Penélope purpurascens)

- “Aguililla blanca” (Leucopternis albicollis)

- “Cigüeña americana” (Mycteria americana)

- “Águila pescadora” (Pandion haliaetus)