PRÁCTICA 10: EVALUACIÓN DE CLADOGRAMAS MEDIANTE EL USO DE ÍNDICES ESTADÍSTICOS

PRÁCTICA 10: EVALUACIÓN DE CLADOGRAMAS MEDIANTE EL USO DE ÍNDICES ESTADÍSTICOS.

Introducción.

La reconstrucción de la historia evolutiva de los organismos es uno de los objetivos principales de la biología evolutiva y, con ello, permite inferir los procesos o eventos que han dado origen a la distribución y extraordinaria diversidad de organismos del planeta (Lipscomb 1998). A nivel biogeográfico, los estudios filogenéticos no solo son importantes a nivel evolutivo, sino que son de gran relevancia en la determinación del supuesto de monofilia de los grupos de estudio. Cuando se tiene un árbol filogenético es conveniente conocer que tan bien se encuentra respaldado por la matriz de datos subyacente. Se considera que los árboles que suponen pocos cambios homoplásicos son más confiables que aquellos que suponen muchos cambios de este tipo. Los árboles con poca o ninguna homoplasía se ajustan bien a una matriz de datos. Esto es, cuando hay poca o ninguna homoplasía, todos o la gran mayoría de los caracteres (con excepción de las autapomorfías o los caracteres poseídos por todos los taxones terminales) respaldan la existencia de los grupos monofiléticos obtenidos, sin tener que asumir orígenes paralelos o reversiones. 

Desde este punto de vista entre menor sea la cantidad de homoplasía mejor será el ajuste entre un árbol y la matriz de datos subyacente. Se han propuesto varias medidas para evaluar la cantidad de homoplasía presente en un árbol, y todas ellas proporcionan una idea acerca de la manera con la cual la información contenida en la matriz de caracteres involucrada respalda las relaciones reflejadas en el mismo. Estas medidas también pueden ser útiles para elegir algún cladograma de entre varias alternativas igualmente parsimoniosas (obtenidas con los mismos taxones pero distintas matrices de datos). Las medidas estándar son (Kitching, 1998): (1) longitud del cladograma, (2) índice de consistencia e (3) índice de retención.

OBJETIVO.

Analizar los índices comúnmente utilizados para evaluar el ajuste entre un conjunto de datos y un cladograma; índices: Consistencia, homoplasía, retención y consistencia reescalado.

PROCEDIMIENTO

El profesor nos proporcionó una serie de números para nuestra matriz de datos, en donde podríamos indicar la presencia o ausencia de cierto carácter en un determinado taxón, nosotros colocamos esos datos en una tabla.

Una vez vaciados los datos en la tabla se empezo a realizar pequeñas pruebas con ramas en cada taxón  para ver con cuales otros compartían uno o más caracteres.