SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS DE PROTEÍNAS EN GEL DE POLIACRILAMIDA CON SDS

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Problema Nº 5

[pic 3]

Mr= 97135, donde se divide entre 1000 para conocer su masa en kDa.

Masa molecular= 97.1 kDa

La posible proteína presente en el problema Nº 5 con masa molecular de 97,1 kDa es la Fosforilasa B, cuando la fosforilasa está en forma b (desfosforilada) la enzima presenta cooperatividad positiva en la fijación de los substratos, fosfato inorgánico y glucógeno (efectos homotrópicos). Pero además la enzima puede ser activada por AMP (débilmente por IMP) e inhibida por ATP, ADP, glucosa-6-fosfato y glucosa (efectos heterotrópicos).

[pic 4] Vista 3D de la proteína Fosforilasa b

Problema Nº 7

[pic 5]

Mr= 14004, donde se divide entre 1000 para conocer su masa en kDa.

Masa molecular= 14,004 kDa → 14 kDa

La posible proteína presente en el problema Nº 7 con masa molecular de 14 kDa es la proteína de replicación A RPA14, La proteína de replicación A es un complejo proteico que se une al ADN. Está implicada en muchos procesos metabólicos en eucariotas, en especial la replicación del ADN, su reparación y la recombinación genética. Al unirse al ADN durante la replicación evita que se pliegue sobre sí mismo para formar estructuras secundarias. Esto mantiene el ADN desenrollado para que la polimerasa pueda realizar su tarea.

También puede unirse a ADN de cadena doble, aunque con mucha menor afinidad. Se compone de tres subunidades:

- RPA70, por su peso molecular, 70 kDa.

- RPA32, de 32 kDa.

- RPA14, de 14 kDa. Ésta última es la que se sitúa en la zona de unión con el ADN.

[pic 6]

Vista 3D de la proteína RPA14

CONCLUSIONES

- Los resultados obtenidos en el laboratorio fueron satisfactorios y se cumplió con todos los objetivos, se pudo determinar las posibles proteínas que resultan de este laboratorio y hacer una pequeña referencia sobre su funcionalidad o estructura.

- Lo mas importante que cabe resaltar es que ya se esta preparado para afrontar un laboratorio con un sistema de electroforesis y con proteínas de verdad.

- Es muy importante conocer como se hace una electroforesis, porque al aislar las proteínas podemos en un caso clínico conocer las fallas o el mal funcionamiento de las proteínas, así llegar a un diagnostico y a un tratamiento

BIBLIOGRAFIA

- http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

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- http://www.cultek.com/inf/otros/soluciones/Soluciones-Electroforesis-protocolos.pdf

- http://www.acsoja.org.ar/images/cms/contenidos/512_b.pdf

- http://www.biorom.uma.es/contenido/biomodel/lab/sds-page/inicio.htm

- http://myeloma.org/pdfs/U-PEP-Span-2011_e1web.pdf

- http://es.wikipedia.org/wiki/Electroforesis